\ No newline at end of file
は、新しいdpkg-sourceでは問題ないのではありませんでしたか?
dpkg (1.4.0.19) unstable; urgency=low
  (中略)
  * dpkg-source now properly handles '\ no newline in source' message from
    patch (fixes #5041).
-- 
ささやま <Kaz.Sasayama@xxxxxxxxxxxxxxx> / 有限会社ハイパーコア
「日本で最初のDebian GNU/Linuxコンサルタント」
* <URL:http://www.debian.org/consultants.html#Japan> を参照