皆さん有難うございます。 まだ原因不明(というか原因究明の力がない)ですが、kernel2.4.24-1-686に戻せ ば正常になるので、とりあえず戻して使用しています。 kernel-2.6.6-1-686にすると、マウスカーソルの移動速度もほぼ倍に、デスクト ップのアニメーションの速度も倍になることから、タイマー割り込み周期あたり のカーネルのコンパイルオプションの設定をカスタマイズして自分でカーネルを 作成したら正常になるのでしょうか？ カーネルコンパイルをしたことはないのですが、可能性があるなら一度トライし てみようかと思います。