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[debian-users:50270] apache2のバーチャルサーバで特定のドメインだけ、挙動がおかしい

お世話になります。

Debian-Linux3.1 上で、apache2のバーチャルサーバ設定で、
特定のドメインだけ、挙動がおかしくなり、質問です。
設定ファイルは、Debianのルールに基づき、バーチャルサーバご とに１ファイルを 作成して、a2ensiteで /etc/apache2/sites-enabled へシ ンボリックリンクを 
追加していく方法を採用しています。
ただし、apacheの再起動をせず、サブドメインの追加を即時反映 させたいので、 Mod_vhost_aliasを利用した設定ファイルを用意して、１ドメインにつ き、 
設定ファイルを２つ用意しています。

これを、Web画面からドメイン追加を行なえるよう環境を作り、
100以上のドメインが、この仕組みで正常に動作しています。


問題になっているドメインは、どの階層、ファイルへアクセスしても、
「Object not found!」の404エラーが表示されます。

この時に、気になったのが、apache2のエラーログで、
以下の行が出力されていました。
http://ex-sample.net/ へアクセスした時のエラーログ（ドメイン名は 仮のものです）
[Wed Mar 19 15:54:12 2008] [error] [client xxx.xxx.xxx.xxx] File does not exist: /home/ex-sample.net/ex-sample 

この場合、「ex-sample.net」のドキュメントルートは
「/home/ex-sample.net/public_html/」が設定されていて、
「/home/ex-sample.net/ex-sample」が存在しないのは理解でき るのですが、 「/home/ex-sample.net/ex-sample」を参照させる設定を一切行 なっていないこと、 他のドメインは、ドメイン名だけを置換した設定ファイルで、期待通り の動作をしていて、 
このドメインだけが、おかしな動作をする理由が分かりません。
また、この症状が起こってから、別のドメインを同様の仕組みで追加し て、 
こちらは問題なく動作しています。
すでに100を超えるドメインが動作していますが、このことから、
サーバで動作させられるドメインの上限を超えている、とは
考えにくいと思われます。

今回問題が起きたのが、「.net」のドメインですが、
他のドメインで「.net」のものもあり、これらは正常に動作して います。 

ドメインの文字列がおかしいのか、と疑いましたが、
文字列内に特殊な文字などはなく、ハイフンが含まれているものの、
「.com」ドメインでは、ハイフンが含まれたドメインが正常に動 作しています。 

同様の症状を経験した方、解決方法をご存知の方、
ご教授いただければ幸いです。

404エラーページに表示された内容から、
apache2のバージョンは以下の通りです。
Apache/2.2.3 (Debian) mod_python/3.2.10 Python/2.4.4 PHP/5.2.0-8 +etch10 mod_ssl/2.2.3 OpenSSL/0.9.8c mod_perl/2.0.2 Perl/v5.8.8 


このドメインの設定ファイルは、以下の通りです。

# ドメイン「ex-sample.net」用
#cat /etc/apache2/sites-available/ex-sample.net
NameVirtualHost *:80
<VirtualHost *>

   ServerName ex-sample.net
    ServerAlias www. ex-sample.net
    DocumentRoot /home/ex-sample.net/public_html/

    <Directory /home/ex-sample.net/public_html/>
        Options -Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI
        AddHandler cgi-script .cgi
        AllowOverride AuthConfig FileInfo Indexes
        Order allow,deny
        allow from all
    </Directory>

    # Possible values include: debug, info, notice, warn, error, crit,
    # alert, emerg.
    LogLevel warn

    # CustomLog /var/log/apache2/access.log combined
    # ServerSignature On
    CustomLog /var/log/apache2/access.log vhost
    ErrorLog /var/log/apache2/error.log

</VirtualHost>
# サブドメイン「xxx.ex-sample.net」対応（再起動なしに、サ ブドメイン追加を認識するよう設定） 
# cat /etc/apache2/sites-available/var. ex-sample.net
NameVirtualHost *:80
<VirtualHost *>

    # ServerAdmin
    UseCanonicalName Off
    VirtualDocumentRoot /home/ex-sample.net/%1/public_html/
    ServerName web-singer.net
    ServerAlias *.web-singer.net

    <Directory /home/ex-sample.net/%1/public_html/>
        Options -Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI
        AddHandler cgi-script .cgi
        AllowOverride AuthConfig FileInfo Indexes
        Order allow,deny
        allow from all
    </Directory>

    <Directory /home/ex-sample.net>
        Options -Indexes
        AllowOverride AuthConfig FileInfo Indexes
        Order allow,deny
        allow from all
    </Directory>

    # Possible values include: debug, info, notice, warn, error, crit,
    # alert, emerg.
    LogLevel debug

    # CustomLog /var/log/apache2/access.log combined
    # ServerSignature On
    CustomLog /var/log/apache2/access.log vhost
    ErrorLog /var/log/apache2/error.log

</VirtualHost>


よろしくお願いします。

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天本　ml@xxxxxxxxxx