はじめまして、ぽぴーと申します。
最近私も同じことではまっていました。(etch, uim, anthyという環境です)
そのときやってみたのが、uim-pref-gtkを立ち上げて、
全体設定
入力方式の利用準備
デフォルトの入力方式を指定する のチェックを外す
使用可能にする入力方式 "Anthy"
としてみたところ入力/かな漢字変換できるようになりました。
また、uim-toolbar-gtkを立ち上げて、
入力モードを確認されるのもいいかもしれません。
はずしていたらすみません。
以上です。